MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	CCA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197946
2	NC_004556	TAG	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
3	NC_004556	AGT	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
4	NC_004556	ACA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
5	NC_004556	TAC	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197946
6	NC_004556	AC	4	8	456	463	50 %	0 %	0 %	50 %	28197946
7	NC_004556	TTG	2	6	480	485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197946
8	NC_004556	CTCG	2	8	503	510	0 %	25 %	25 %	50 %	28197946
9	NC_004556	TGC	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197946
10	NC_004556	TGG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197946
11	NC_004556	TGC	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197946
12	NC_004556	TTCG	2	8	663	670	0 %	50 %	25 %	25 %	28197946
13	NC_004556	ATTG	2	8	757	764	25 %	50 %	25 %	0 %	28197946
14	NC_004556	T	6	6	776	781	0 %	100 %	0 %	0 %	28197946
15	NC_004556	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197946
16	NC_004556	ATT	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197946
17	NC_004556	CGAT	2	8	939	946	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
18	NC_004556	CCT	2	6	947	952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197946
19	NC_004556	A	8	8	1039	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	28197946
20	NC_004556	TAG	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197946
21	NC_004556	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
22	NC_004556	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197946
23	NC_004556	CTGA	2	8	1310	1317	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
24	NC_004556	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197946
25	NC_004556	GTA	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
26	NC_004556	TAA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28197947
27	NC_004556	GAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
28	NC_004556	CAAAAA	2	12	1910	1921	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	28197947
29	NC_004556	GAT	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
30	NC_004556	TAT	3	9	2124	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
31	NC_004556	TTA	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
32	NC_004556	CAA	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197947
33	NC_004556	TTA	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
34	NC_004556	TG	3	6	2279	2284	0 %	50 %	50 %	0 %	28197947
35	NC_004556	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
36	NC_004556	TTA	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
37	NC_004556	ATTG	2	8	2451	2458	25 %	50 %	25 %	0 %	28197947
38	NC_004556	GGC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197947
39	NC_004556	GTG	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197947
40	NC_004556	AAG	3	9	2642	2650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197947
41	NC_004556	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197947
42	NC_004556	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197947
43	NC_004556	GTG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197947
44	NC_004556	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197947
45	NC_004556	AGT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197947
46	NC_004556	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197948
47	NC_004556	TTTC	2	8	3206	3213	0 %	75 %	0 %	25 %	28197948
48	NC_004556	T	6	6	3230	3235	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
49	NC_004556	TAAT	2	8	3388	3395	50 %	50 %	0 %	0 %	28197948
50	NC_004556	ACGTCG	2	12	3398	3409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28197948
51	NC_004556	AGT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197948
52	NC_004556	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197948
53	NC_004556	ACG	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197948
54	NC_004556	ATT	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197948
55	NC_004556	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197948
56	NC_004556	AGAA	2	8	3661	3668	75 %	0 %	25 %	0 %	28197948
57	NC_004556	GA	3	6	3750	3755	50 %	0 %	50 %	0 %	28197948
58	NC_004556	AAC	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197948
59	NC_004556	TTTTAA	2	12	3815	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197948
60	NC_004556	ATGG	2	8	3829	3836	25 %	25 %	50 %	0 %	28197948
61	NC_004556	CGT	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197948
62	NC_004556	TTGA	2	8	3855	3862	25 %	50 %	25 %	0 %	28197948
63	NC_004556	TTTA	2	8	3866	3873	25 %	75 %	0 %	0 %	28197948
64	NC_004556	T	6	6	3968	3973	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
65	NC_004556	CTA	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197948
66	NC_004556	T	6	6	4032	4037	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
67	NC_004556	T	6	6	4187	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	28197948
68	NC_004556	AGAA	2	8	4517	4524	75 %	0 %	25 %	0 %	28197949
69	NC_004556	GATA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	28197949
70	NC_004556	GCT	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
71	NC_004556	GGC	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197950
72	NC_004556	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	28197950
73	NC_004556	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
74	NC_004556	CAC	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197950
75	NC_004556	GTCT	2	8	4976	4983	0 %	50 %	25 %	25 %	28197950
76	NC_004556	AGA	2	6	5027	5032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197950
77	NC_004556	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
78	NC_004556	CGA	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197950
79	NC_004556	TGG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
80	NC_004556	CAA	2	6	5199	5204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197950
81	NC_004556	TAC	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
82	NC_004556	TCCT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
83	NC_004556	AGTT	2	8	5378	5385	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
84	NC_004556	TGAT	2	8	5386	5393	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
85	NC_004556	GTG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
86	NC_004556	GGT	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197950
87	NC_004556	TTG	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197950
88	NC_004556	TGC	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
89	NC_004556	TGC	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
90	NC_004556	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197950
91	NC_004556	TTC	2	6	5771	5776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197950
92	NC_004556	GGA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197950
93	NC_004556	TGC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
94	NC_004556	GCT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
95	NC_004556	TCG	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
96	NC_004556	CTG	2	6	6055	6060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
97	NC_004556	A	6	6	6089	6094	100 %	0 %	0 %	0 %	28197950
98	NC_004556	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
99	NC_004556	TCA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
100	NC_004556	T	7	7	6312	6318	0 %	100 %	0 %	0 %	28197950
101	NC_004556	ATTG	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
102	NC_004556	GCC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
103	NC_004556	GCC	2	6	6491	6496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
104	NC_004556	AT	3	6	6533	6538	50 %	50 %	0 %	0 %	28197950
105	NC_004556	CGC	2	6	6539	6544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
106	NC_004556	CCT	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197950
107	NC_004556	TGA	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197950
108	NC_004556	ACA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197950
109	NC_004556	GCC	2	6	6750	6755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197950
110	NC_004556	TTG	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197950
111	NC_004556	CAAT	2	8	6912	6919	50 %	25 %	0 %	25 %	28197950
112	NC_004556	GAA	2	6	6962	6967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197950
113	NC_004556	TAC	2	6	7028	7033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197950
114	NC_004556	TGC	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197950
115	NC_004556	CAGT	2	8	7436	7443	25 %	25 %	25 %	25 %	28197951
116	NC_004556	TGG	2	6	7485	7490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197951
117	NC_004556	ATTG	2	8	7492	7499	25 %	50 %	25 %	0 %	28197951
118	NC_004556	GTT	3	9	7516	7524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197951
119	NC_004556	TGA	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197951
120	NC_004556	CAT	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197951
121	NC_004556	GC	3	6	7568	7573	0 %	0 %	50 %	50 %	28197951
122	NC_004556	T	8	8	7631	7638	0 %	100 %	0 %	0 %	28197951
123	NC_004556	GC	3	6	7721	7726	0 %	0 %	50 %	50 %	28197951
124	NC_004556	TTTG	2	8	7732	7739	0 %	75 %	25 %	0 %	28197951
125	NC_004556	TCG	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197951
126	NC_004556	ATT	2	6	7780	7785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197951
127	NC_004556	GT	3	6	7794	7799	0 %	50 %	50 %	0 %	28197951
128	NC_004556	ATT	2	6	7913	7918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197951
129	NC_004556	TAC	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197951
130	NC_004556	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197952
131	NC_004556	A	6	6	8130	8135	100 %	0 %	0 %	0 %	28197952
132	NC_004556	GTG	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197952
133	NC_004556	GCA	3	9	8228	8236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197952
134	NC_004556	TTG	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197952
135	NC_004556	CGTTG	2	10	8322	8331	0 %	40 %	40 %	20 %	28197952
136	NC_004556	GAA	2	6	8403	8408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197952
137	NC_004556	TGCTTT	2	12	8414	8425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28197952
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139	NC_004556	GCT	2	6	8490	8495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197952
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141	NC_004556	TCA	2	6	8531	8536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197952
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143	NC_004556	TGC	2	6	8621	8626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197952
144	NC_004556	GACT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	28197952
145	NC_004556	TTG	2	6	8713	8718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197952
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152	NC_004556	CTG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
153	NC_004556	TGC	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197953
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163	NC_004556	TTA	2	6	9647	9652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197953
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256	NC_004556	GGA	2	6	15270	15275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197958
257	NC_004556	TC	3	6	15282	15287	0 %	50 %	0 %	50 %	28197958
258	NC_004556	CCG	2	6	15334	15339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197958
259	NC_004556	CAAC	2	8	15356	15363	50 %	0 %	0 %	50 %	28197958
260	NC_004556	TAC	2	6	15484	15489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197958
261	NC_004556	GCGTC	2	10	15777	15786	0 %	20 %	40 %	40 %	28197958
262	NC_004556	TA	3	6	15789	15794	50 %	50 %	0 %	0 %	28197958
263	NC_004556	GGTG	2	8	15879	15886	0 %	25 %	75 %	0 %	28197958
264	NC_004556	CTC	2	6	15963	15968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197958
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266	NC_004556	CTT	2	6	16271	16276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197959
267	NC_004556	CTG	2	6	16348	16353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197959
268	NC_004556	CTG	2	6	16519	16524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197959
269	NC_004556	GCT	3	9	16560	16568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197959
270	NC_004556	TGA	2	6	16628	16633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197959
271	NC_004556	GAT	2	6	16650	16655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197959
272	NC_004556	ACC	2	6	16669	16674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197959
273	NC_004556	CTG	2	6	16678	16683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197959
274	NC_004556	GAT	2	6	16755	16760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197959
275	NC_004556	G	11	11	17153	17163	0 %	0 %	100 %	0 %	28197960
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280	NC_004556	TGA	2	6	17443	17448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197960
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282	NC_004556	CGA	2	6	17500	17505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197960
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284	NC_004556	GGC	2	6	17579	17584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197960
285	NC_004556	TGA	2	6	17593	17598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197960
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288	NC_004556	ATT	2	6	17782	17787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197960
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298	NC_004556	ATG	2	6	20995	21000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197961
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300	NC_004556	T	7	7	21072	21078	0 %	100 %	0 %	0 %	28197961
301	NC_004556	ATT	2	6	21079	21084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197961
302	NC_004556	ATT	2	6	21122	21127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197961
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391	NC_004556	TTAA	2	8	26434	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	28197966
392	NC_004556	A	7	7	26468	26474	100 %	0 %	0 %	0 %	28197967
393	NC_004556	CAA	2	6	26710	26715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197967
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400	NC_004556	TTC	2	6	27130	27135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197967
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